พระบาทสมเด็จพระเจ้าอยู่หัวและสมเด็จพระนางเจ้าพระบรมราชินีนาถ ได้เสด็จ พระราชดำเนินมาทรงวางศิลาฤกษ์โรงพยาบาลคณะแพทยศาสตร์ เมื่อวันที่ 26 สิงหาคม 2519 เพื่อให้เป็นสถาบันทางด้านการศึกษาวิจัย การรักษาพยาบาลและฝึกงานของบุคลากร ทางด้านการแพทย์ทุกแขนง และได้พระราชทานนามของโรงพยาบาลในภายหลังว่าโรงพยาบาลสงขลานครินทร์
ในเดือนมีนาคม2520 คณะแพทยศาสตร์ก็ได้ย้ายสำนักงานคณบดีชั่วคราวจากคณะเภสัชศาสตร์ มหาวิทยาลัยมหิดลลงมาตั้งชั่วคราว ณ คณะวิศวกรรมศาสตร์ มหาวิทยาลัยสงขลานครินทร์ และในช่วง2 ปีต่อมา คือ เดือนมีนาคม 2522 คณะแพทยศาสตร์ก็ได้บัณฑิตที่จบการศึกษารุ่นแรกจำนวน 31 คน
โรงพยาบาลสงขลานครินทร์ซึ่งเป็นโรงพยาบาลที่ใช้ในการเรียน การสอน และการรักษาพยาบาลของคณะ สามารถเปิดบริการรักษาพยาบาลแก่ประชาชนทั่วไปอย่างเป็นทางการจำนวน 100 เตียงแรก ได้เมื่อ 22 กุมภาพันธ์ 2525 ทำให้ประชาชนผู้ป่วยไข้ ได้รับบริการทางการแพทย์จากสถานบริการ ที่มีคุณภาพเพิ่ม ขึ้นอึกแห่งหนึ่งในภาคใต้
จนกระทั่งถึง18 กันยายน 2529 พระบาทสมเด็จพระเจ้าอยู่หัว และสมเด็จพระเทพรัตนราชสุดา ก็ได้เสด็จพระราชดำเนินมาทรงกระทำพิธีเปิดโรงพยาบาลสงขลานครินทร์ นับเป็นศิริมงคล และสร้างความซาบซึ้งในพระมหากรุณาธิคุณให้กับบุคลากรในคณะ มหาวิทยาลัย และ ประชาชนชาวภาคใต้ เป็นอย่างยิ่ง
ทางด้านการวิจัยสมเด็จพระพี่นางเธอเจ้าฟ้ากัลยานิวัฒนา เสด็จเปิดอาคารวิจัย รัตน์ ประธานราษฎร์นิกรในวันที่ 18 กันยายน 2535 ซึ่งอาคารดังกล่าวใช้เป็นสถานที่ทำการภาควิชาชีวเวชศาสตร์และห้องปฎิบัติการสัตว์ทดลอง
การให้บริการรักษาพยาบาลอย่างเร่งด่วนแก่ผู้ประสบอุบัติเห;ตุ ในวันที่ 21 กันยายน 2535 สมเด็จพระเทพรัตนราชสุดาสยามบรมราชกุมารี เสด็จพระราชดำเนินมาทรงวางศิลาฤกษ์อาคารอุบัติเหตุ และฉุกเฉิน ซึ่งพระบาทสมเด็จพระเจ้าอยู่หัว พระราชทานนามว่า' อาคาร 100 ปี สมเด็จพระบรมราชชนก '
ในการให้บริการรักษาพยาบาลทั่วไปปัจจุบัน โรงพยาบาลของคณะแพทยศาสตร์ สามารถเปิดบริการรับคนไข้ใน ได้ จำนวน635 เตียง